blastn和blastx的區別
1、 blastn:是將給定的核酸序列與核酸資料庫中的序列進行比對
2、 blastx:將給定的核酸序列按照六種閱讀框架將其翻譯成蛋白質與蛋白質資料庫中的序列進行比對。作用:對分析新序列和esT很有用
EST:Expressed Sequence Tag的縮寫,意思是表達序列標籤,指從一個隨機選擇的cDNA 克隆,進行5’端和3’端單一次測序挑選出來獲得的短的cDNA 部分序列。
六種閱讀框架:一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。開放閱讀框包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列,不能被終止子打斷。 當一個新基因被識別,其DNA序列被解讀,人們仍舊無法搞清相應的蛋白序列是什麼。這是因為在沒有其它資訊的前提下,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯(核酸有兩條鏈,每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)。
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