根部面具和暗部面具區分

1、實質領導人不同

暗部直屬於（歷代）火影，聽從火影調遣，有時候也會配合上忍的工作

即便第三代火影退休後，他依然有自己的直屬暗部

根僅忠實於團藏，是團藏建立並培養的只服從自己命令的組織。

也正是因爲“團藏”與“三代”這兩個人物的割裂性，使得名義上是從屬關係的暗部與根在實際上爲並列關係（平級）

2、根比暗部要更加神祕

暗部雖然名稱叫暗部，但是其實暗部裏許多高手的資訊都是“半透明”的，譬如在《者之書》中對大和的評述：

他在暗部內發揮着出類拔萃的實力。“木遁天藏”的勇名無人不知。

又比如木葉的拷問專家——森乃伊比喜，在圍剿幹柿鬼鮫保護的霧隱暗號部的時候被鬼鮫一眼認出。

但是根並不一樣，團藏與根的存在相較於暗部要更加神祕，根的情報保密工作要做的更好

3、暗部不僅是暗部，但根只是根

暗部內其實還有多個部門。還是森乃伊比喜這個例子，他就是暗部的刑訊審問部隊長，這說明暗部內也是有其他專門的部門的，並且這些部門會和木葉的正規部門合作（比如森乃伊比喜和山中亥一在木葉情報部聯合進行雨隱忍者的情報工作）

但是從目前的情況來看，根的組織架構可能要單一一些

4、根比暗部要更加——泯滅人性

這個其實跟人物刻畫也有一定的關係