協查函和調查令是一回事嗎

不是一回事

協查函就是國家機關給公民、法人或者其他組織下發的協助其調查某一事件的信函。 調查令是司法機關給公民、法人或者其他組織下發的定於某年月日調查取證的通知。 

協查函裡指定的人員也是調查的主體，只不過是協助調查，不是被調查者而調查令指定的人員既可能要參與調查也可能是被調查的人。