cca分析思路
心理2.99W
cca是基于对应分析发展而来的一种排序方法,将对应分析与多元回归分析相结合,每一步计算均与环境因子进行回归,又称多元直接梯度分析。此分析是主要用来反映菌群与环境因子之间关系。cca 是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样品、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。
cca模型的选择原则:先用species-sample 数据(97%相似性的样品OTU 表)做DCA 分析,看分析结果中Lengths of gradient 的第一轴的大小,如果大于4.0,就应该选cca,如果3.0-4.0 之间,选RDA 和cca均可,如果小于3.0,RDA 的结果要好于cca。
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