為什麼大蛇丸後來變好了

是因為大蛇丸在死了之後，從御手洗紅豆和藥師兜的身上看見了藥師兜的失敗後，想要見證一個完全不同於自己的人生，從而徹底醒悟。

沒有變好只是有新的認知，大蛇丸一開始並不是什麼反派壞人，只是看到戰爭的殘酷和死亡有了新的想法，之後看到藥師兜和佐助和有了改變。