魚缸裡有好多透明硬殼的東西

白色透明物是硝化細菌的屍體。 原因是你養的魚患有水黴病，水黴病的病原體是絲水黴，病魚體表或鰭條上有灰白色如棉絮狀的菌絲，又稱白毛病，多在秋末早春季節發病。

有害的化合物質就是水中產生的各種無機鹽份象磷酸鹽、亞硝酸鹽等等對魚會產生危害的物質。